此前,新冠HIV已传扬到184个以上的国际组织,并取回了18万多人的生命。世界各地的研究小组都在试图确定地认识HIV的传扬,以为了让防止传扬和开发设计疫苗。众所周知,SARS-CoV-2运应用于与引起2003年SARS流行的关的亚型类似的机制HIV生命细胞内,但腹子里面关的的确定细胞内各种类同型在此之前并未被查明。
昨日,英国惠格数据库分析所、挪威马斯特里赫特国立大学医学里面心、法国人蔚蓝海岸国立大学和法国人国际组织社会科学数据库分析院(CNRS)和法国人尼斯国立大学的数据库分析职员在《自然地医学》上发表了一项数据库分析,可以为了让解释新冠HIV高传扬相对加速的因素。腹里面的两种特定细胞内各种类同型已被未确定为新冠HIV的显然初始HIV点。研究小组推测腹子里面的足球赛锥状和刚毛细胞内掺入高水平的转至抗原,新冠HIV可借助于这些转至抗原转至生命细胞内。
为了推测哪些细胞内显然参与COVID-19传扬,数据库分析职员量化了来自20多个未HIV人群的单个细胞内RNA基因组的多个生命细胞内图解(HCA)数据库集。这些细胞内除此以另有来自呼吸系统、气管、腹子、肠道、心脏、肾脏和甲状腺的细胞内。数据库分析职员寻找哪些单个细胞内暗示了两个关键转至抗原,而这两个关键转至抗原被COVID-19HIV用来HIV生命细胞内。
惠格数据库分析所研究成果的第一编者Waradon Sungnak麻省理工学院说,他们推测可以激活SARS-CoV-2转至的抗原抗原ACE2和TMPRSS2抗原酶在多种不同人体器官的细胞内里面暗示。然后他们推测在腹气道里面所有细胞内里面,产生皱褶的足球赛锥状细胞内和刚毛细胞内里面这两种COVID-19HIV抗原的浓度高达,最确实是该HIV的早先HIV途径。
Sungnak和他的助手用HCA量化了各种的组织里面的ACE2和TMPRSS2暗示,不仅除此以另有新陈新陈代谢的组织——先前运应用于免疫的组织化学进行的量化已经检查到了气管和支气管上皮细胞内里面的ACE2和TMPRSS——-以及来自腹子、消化道和肌肉等。
SARS-CoV-2转至抗原ACE2(第一列)、转至关的抗原酶tmprs2(第二列)的RNA暗示及其在多种不同的组织里面的共暗示(第三列)。
数据库分析职员推测,在所量化的数据库集里面,ACE2遗传的暗示上会很低,而TMPRSS2的暗示极为广泛。这暗示ACE2暗示显然是初始HIV里面HIV转至的约束考量。但是,ACE2在新陈新陈代谢的组织的多种上皮细胞内各种类同型里面暗示,在足球赛锥状细胞内和腹睫锥状细胞内里面其暗示特别高。数据库分析职员运应用于其他两项scRNA-seq数据库分析的数据库证实了这一推测。
上会在呼吸系统部里面与ACE2联合暗示的其他遗传,除此以另有与糖类新陈代谢有关的遗传(显然是由于它们在足球赛锥状细胞内粘抗原合成里面的作用),以及与先天和抗HIV免疫功能有关的遗传。
ACE2和TMPRSS2遗传也在呼吸系统部另有暗示,除此以另有水肿细胞内和循环系统的暗示,数据库分析职员援引,这与一些暗示唾液脱落HIV的诊断报告一致。
这些HIV转至抗原的遗传,在呼吸系统部里面的暗示左边,显然会影响HIV的传扬意志力。数据库分析职员还比较了HIV抗原遗传的的组织暗示来进行与其他亚型和流感HIV运应用于的抗原遗传。总体传染性HIV(如流感HIV)运应用于的抗原在上新陈新陈代谢道里面暗示更多,而传染性比较大的HIV(如MERSCoV)的抗原在下新陈新陈代谢道里面暗示。这向数据库分析职员暗示,HIV抗原的空间分布显然会影响HIV的传扬意志力。
Cell上另一个亦同印本数据库分析 还运应用于了生命、非生命灵长类动物和活体的单细胞内RNA基因组数据库集来检查和暗示ACE2和TMPRSS2遗传的细胞内的左边。由波士顿儿童医院的Jose Ordovas-Montanes麻省理工学院领导的数据库分析职员推测,这两种遗传均在II同型呼吸系统细胞内和回肠吸收性肠上皮细胞内以及腹足球赛锥状分泌细胞内里面暗示。
挪威马斯特里赫特国立大学医学里面心的Martijn Nawijn麻省理工学院代表HCA呼吸系统生命体互联表示,这项数据库分析首次推测腹子里面的这些特殊细胞内与COVID-19关的。尽管有很多影响HIV传扬的考量,他们的推测与此前所见HIV的并能患病率相关联,这些细胞内在气管内表面的左边使其容易HIVHIV,并显然有助于传扬给其他人。
这是《呼吸系统生命体互联》的第一篇刊物,是一项早就进行的国际文书工作的一部分,有助于借助于生命细胞内图解数据库来认识HIV和营养不良。该信息可应用于更佳地认识亚型的传扬。它进一步暗示,腹子和其他一些人体器官里面的细胞内也掺入HIV转至抗原。这项数据库分析还亦同测了关键转至抗原如何被其他免疫系统遗传恒定,并推断出了开发设计减低传扬途径的病人工具的潜在目标。全世界HCA呼吸系统生命体互联将继续量化数据库,以便进一步认识显然参与COVID-19的细胞内和靶标,并将其与患者基本特征关的联。
通过精未确定位每种细胞内各种类同型的确定基本特征,HCA早就以全新的方式为了让研究小组诊断、数据库分析和病人除此以另有COVID-19在内的营养不良。世界早就此之前所未有的加速凸显对COVID-19的认识,这项新数据库分析证明了这一点:跨界密切合作和公开共享数据库分析对并能开发设计有效地的诊断、病人和疫苗至关重要,能保证并未任何国际组织落伍。
注解:
Sungnak,W.,Huang,N.,Bécin,C. et al. SARS-CoV-2 entry factors are highly expressed in nasal epithelial cells together with innate immune genes. Nat Med (2020).
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